mira has lo siguiente te vas a la carpeta custom y borras el custom.xml y todo lo que hay dentro de ahi prendes el celular y te va a marcar error de configuracion eso es bueno ya que vas a subir un custom al cual le vas habilitar los menus colocando true el lugar de false y lo subes con eso deberia quedar
Código:
    <flash-desktop>
      <settings reg-path="/apps/flash-desktop">
        <enabled>true</enabled>
      </settings>
    </flash-desktop>