Ninguno de los 2 es mejor, ya que son diferentes cosas, que por supuesto cumplen diferentes funciones, es lo mismo que pregunta que es mejor una camara de fotos ò un mp3. Como te decian el parche te harà filmar mp4, pero este no mejora la calidad de video, la unica ventaja que le veo es que hace posible que lo reproduscan mas reproductores (valga la redundancia), ya que con 3gp, pocos lo reproducen, en cambio mp4 es mas reproducido.

PD: Respecto al camdriver, tampoco podrìa definir un mejor, los mismos tienen diferentes valores y a cada uno le puede resultar comodo ò incomodo depende de lo que haga, como mucho las mejoras evidentes podrìan ser: mas fps, mas rapidez, etc, ya que algunas como mas calidad es algo subjetivo.
PD2: Yo por ejemplo, utilizo el camdriver W810 5.5 y es uno de los que mas poco calidad traen, ya que la mejora evidente es la rapidez, tanto de enfoque como movimiento.
PD3: Si queres probar camdrivers para tu modelo aqui: Tema oficial para aportes camdriver s500/w580 - Top Sony