viejo, yo uso el ImTOO MPEG Encoder 3 y en los parametros de conversion le doy lo siguiente:
"cualquier formato" a Mp4:
VIDEO:
video size: 320*240
Bit rate: 512
AUDIO:
Bit rate: 48
Sample rate: 44100

a mi de esa forma no se le corre el sonido y se ven de lujo.
Suerte.
si necesitas el serial del ImTOO MPEG Encoder 3 me lo pides por MP.