Amigo esto depende del parche que vas a utilizar, mira:
1. Lo abres con el block de notas, y verificas la ruta que cambia:
tpa/preset/system/desktop/flash------->other/menus (EJEMPLO)
2. Dependiendo la ruta del parche, creas las carpetas y pones los archivos respectivos, entonces crearias en other una carpeta llamada menus y en ella pones los .swf (ejemplo)
3. Luego aplicas el parche
4. Luego disfrutas de poner menus flash sin necesidad de setool ni nada suerte