Flashear se divide en 3 cosas:

Actualizar
Modificar
Reparar

3 aspectos muy importantes ya que al flashear se toca la memoria flash del telofon, una de esta que todos conocemos es donde guardamos nuestros archivmos como imagenes, sonidos etc... sin embargo esto no es todo lo que hay, tambien hay carpetas como las IFS y TPA osea la FS uno de los 3 archivos con que se flashea

tu duda de parches es modificar la main osea alterarla osea darle nuevas funciones al telefono o reemplazar las imagenes en casoo de usar imagenn 2 tool