Mira, los menus flash (archivos .swf) se guardan en el FS (File System) y éstos archios no son visibles, a menos que subas un parche a tu cel para verlos/borrarlos, etc...
Si subiste el customize_upgrade.xml a la ruta /tpa/preset/custom/ ya tienes los menus flash activados en tu equipo, sólo restaría subir los archivos .swf y .thm a tu teléfono.
Ruta de los archivos .swf: /tpa/preset/system/desktop/flash/
Ruta de los archivos .thm: /tpa/user/theme/ o igual los puedes subir en modo de transferencia de archivos a la carpeta de los temas.

Cabe mencionar que los archivos .thm deben de estar ligados a los archivos .swf (como un hipervínculo), ésto para que se activen ambos al seleccionar X tema (a ésto se le llama tema activador)

Espero y te haya servido la información.
Saludos