Es más fácil instalar la Actualización cuando la Instalación Previa de SETool2Lite la realizas sobre alguna Carpeta en la Raíz de C:\...

Ej. C:\SETool

Así será más fácil descompactar los archivos de la Actualización en esa Carpeta.

NOTA: ya teniendo esa carpeta la puedes Respaldar para que no tengas que realizar este proceso cada vez que instalas SETool2Lite...