Amigo, lo que pasa es que creo que entendiste mal los tutoriales, lo que tienes que hacer es esto(lo que yo hago):
1.-Tener en una carpeta llamada "menus flash" todos los menus en flash que tengas, osea todos los archivos con extension ".swf", para tenerlos todos ordenados.
2.-Tener una carpeta llamada "Temas", todos los temas con extencion thm, que activan a cada menu flash de los que vas a subir.
3.-Ya teniendo todo en orden, lo que vamos a hacer es crear la siguiente ruta "tpa\preset\system\desktop\flash" y despues copiar todos los menus flash dentro de la carpeta que se llama flash. ahora salimos de la ruta, hasta toparnos con la carpeta llamada "tpa", la cual la comprimes en un zip y la subes con el setool lite
4.-Cabe mencionar que el "CUSTOMIZE_UPGRADE", solo se aplica una vez, esto quiere decir que solo sirve para habilitar los menus flash a un movil que los tiene bloqueados por su compañia.
5.-Cuando terminen de subir los menus con el setool, conecta tu movil en modo transferencia de archivos y vas a la carpeta de temas y alli coloas todos los temas que estan en la carpeta con el mismo nombre, que creamos en los pasos anteriores.
6.-Lo unico que tienes que hacer es encender tu movil y aplicar uno de los temas que acabamos de subir y listo tu menu quedara muy bien.
Saludos
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