miguel8e tiene toda la razón, seguramente aplicaste el parche pero te olvidaste de crear las carpetas, eso mismo pasa por ejemplo cuando mueves la carpeta de los menus flash al teléfono, tienes que crearlas manualmente.
Y también asegurate de mover el custom.

P.D. solo se le olvido decirte si la carpeta se crea en la stick o en el teléfono, porque la de los menus flash se crea en la stick, pero no estoy seguro si también éstas puesto que no uso ese parche.

Imaginate si por accidente alguien le mete mano a tu teléfono y le borra algo???
Yo creo que es más seguro meterle los acoustics y los drivers mediante SeTool como dice angelvip.