Mira a lo primero que dices, no es necesario subir los skin
predeterminados con los que viene tu telefono de fabrica,
solo sube los skin de tu gusto y listo.
De lo ultimo que hablas para subir archivos solo
con setool 2 lite se comprimen en .zip con su respectiva ruta,
con el far manager solo subes el archivo, en este caso
es skin, debes de subir completamente la carpeta,
a la ruta y listo, con eso tendras skin en tu telefono.