Código:
 Setting up GDFS...
 format gdfs complete.
will write 760697659 variables
cut length from 877797424(57/3138)
FAIL: gdfs blk/unit:87/3138
 Exception in GDFS write. maybe bad gdfs file.
Elapsed:32 secs.
No habras presionado "Write GDFS" en lugar de "Write Script" al querer aplicar ese parche, o sí?

Si tienes un backup de tu GDFS, puedes usarlo, seleccionas tu backup en Misc, y presionas Write GDFS, con eso revive

Si no hiciste un backup de tu GDFS (que debiste hacerlo), tienes un lindo pisapapeles en forma de W810..., a menos que lo lleves donde un tecnico que le escriba la GDFS con una box

Otra cosa, usa la versión 1.11 de setool2 lite, o por lo menos debiste usar la versión 1.08, que te hubiera advertido que estabas tocando la GDFS...