si estas usando el Virtual boy a algo parecido en primera no necesitas convertir los archivos a jar sino agregarlos al JAR del Programa de emulador esto se hace con WINRAR, abre el Jar del emulador de juegos (nintendo por ser la extension NES) ahi veras alguno que otro juego dentro del Jar, solo arrastra el archivo nes (juego) hacia dentro del winrar (archivo JAR abierto) y listo cierras WINRAR despues de meterle los juego (OJO) No cambies la extension solo cierra el programa eso es todo y listo tendras el emulador listo con todos los juegos que le metas al archivo JAR

ten en cuenta que son muchos y cuando le metes demasiados puede llegar a alentar l emulador por la cantidad de Juegos Prueba con pocos y me dices saludos