Para instalarlo pues simplemente debes comprimir el customize_upgrade.xml y el halmer.cer en un zip con la ruta indicada (tpa/preset/custom) y lo pones en MISC y le das a FLASH. Eso sería así teoricamente, pero yo lo hice muy facilmente con FarManager.

Para asegurarte de que ya tienes instalado el certificado debes hacer esto:
Menu>Ajustes>Seguridad>Certificados>Certificados Java (y ahi deberia salir uno llamado Halmer, y si no sale, pues no se instalo correctamente el certificado).

Luego de hacer esto, debes "firmar" a la aplicación en formato .jar con el EQHalmer que dejan en el tutorial y ya te quedaría el .jad. Los subes al teléfono e instalas el .jad. Despues te vas a donde esta la aplicación, le das a Más>Permisos>Leer datos usuario>Nunca preguntar... Listo, saludos amigo...