Cuando verificas el espacio de cualquier medio de almacenamiento, ya sea una tarjeta de memoria, una memoria USB, un disco duro, etc. a traves de una pc con Windows, el sistema operativo utiliza cierta parte de el espacio total para poderlo reconocer como parte de la computadora, es decir, en esa pequeña parte que toma de espacio, guarda la estructura de archivos para que puedas trabajar con tu unidad de almacenamiento ya sea para escribir o para leer información.

Por ejemplo si instalas un disco duro de 40 gigas en tu computadora, windows solo te va reconocer 37 gigas, y no es que este dañado el disco o tenga virus, simplemente asi lo reconoce el sistema operativo, lo mismo sucede con tu telefono.