el Customize.xml
contiene muchos datos de tu telefono
Te invito a que lo explores con el Bloc de Notas.

Y el Customize_upgrade.xml es un archivo que "actualiza" el customize.xml
Tu pones lo que quieras agregar en el Customize.xml dentro del ...upgrade y automaticamente lo agrega al CUSTOMIZE.XML

Este metodo evita que tengas que resetear tu telefono para que cambien las configuracoines del Customize.xml porque sino cada vez que cambies algo en EL te tocaria resetear ajustes. Y con el Customize_Upgrade evitamos eso.
Espero que lo entiendas.