amigo por ejemplo las apps que vienen en el system/app, te menciono algunos: facebook, google maps, market, youtube, trackid, busqueda por voz etc. cuando te sale actualizacion en el market y actualizas esas actualizaciones se guardan en la ruta data/app y la version anterior sigue quedando en la system/app te recomiendo que borres las que estan en system/app y mover las que estan en data/app de la siguiente manera con el root explorer mueves de data/app a system pones los permisos y luego mueves a la carpeta app y reinicas el telefono asi ganas mas memoria has la prueba y me cuentas.