ambos son similares,
tienen el mismo procesador a 1.5 ghz, ambos tienen 1gb en ram, andriod 2.3 etc
lo que cambia unj poco es la interfaz de usuario, seria elegir entre HTC Sense 3.5 ó TouchWiz 4.

Podrias esperar un poco a que samsung saque el Nexus Prime junto con google, el proximo martes 11

Saludos