el flasheo es como formatear un ordenador man, asi que si flasheas tu cel quedara como nuevo, pero el flasheo no arregla cosas fisicas como es el problema que indicas de otra aplicacion en ejecucion, si usas buscar vas a encontrar muchos temas parecidos o identicos al tuyo con el mismo problema, no pierdes nada con flashear y salir de dudas!
saludos!