full flash y actualizar es lo mismo. Y sí pierdes todas las modificaciones que le hayas hecho con cualquier método. Una forma de borrar las aplicaciones sería volviendolas a instalar o metiendote a la carpeta system/ams y borras todos los archivos. Así sin necesidad del flash o actualización. La diferencia entre full flash y actualizar es que en el flasheo puedes elegir que firm ponerle.