lo que yo ago es lo siguiente

primero me concegui el phone app.cxc de mi firm y ese es el que le meto los parches
con el far 2.0 con el plug in cxc patcher parcho el archivo que tengo en mi compu
y despues con el a2uploader subo ese archivo al cel conectandolo en modo flash
y de esa manera no tengo problemas de nada

pero por si acaso siempre ten una copia de seguirdad de tu phone app original por si se te daña el que parchas