hola mira , los camdrivers, font, menus flash, skins, etc, todos los archivos que subiste a una ruta, se guardan en el FS ( file system), y si solo flasheas main no se borraran esas personalizaciones, ya que no tocas el FS , en cambio como lo mencionas todos los parches se aplican en el main, y al flashear se borran todos los parches aplicados sale, mira pues primero flashea solo main, si sigue sin prender tendras que flashear el FS y CDA y volver subir los archivos.

saludos