No puedes subirlos con quick acces ya que no son parches, lo que tienes que hacer es usar far y colocando los temas que terminan con extencion .SWF en la ruta tpa/preset/system/desktop/flash
y los que terminan en .thm en el telefono como cualquier tema.
lo que si tienes que hacer antes es activarlos con el customize upgrade, hay varios tutoriales por aqui solo es cuestion de buscar
Saludos!