Para que lo reconosca debes de tener instalado los flash drivers, una vez instalados el programa te reconocera el celular.

Para un flasheo completo, es necesario cargar la FS, MAIN y subir el custom para finalizarlo. Si solo quieres flashear la MAIN, solo se agrega y listo, no hace falta nada mas.

Podrias intentar flashear solamente la MAIN, si no da resultado realiza un flash completo.

Saludos.