no mira man customize_upgrade.xml eso
va en la ruta tpa-preset-custom eso activa los menus flash

y otra cosa no se deben de unir ni nada

un menu flash se conforma de 2 cosas

el tema que es el thm y el swf que le da la apariencia cambiada osea te cambia el menu

osea al descargarte un menu flash te vienen estos 2 archivos
SWF= QUE te da modificada del menu
THM= es el menu normal al activar este se activa el swf y listo te cambia el menu

el customize_upgrade.xml lo que ase es activar los menus flash
para que se puedan usar

los swf van en la ruta- tpa-preset-system-desktop-flash

PD: LOS THM van el la carpeta themes o temas en tu cel normal